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저장용기는 플라스틱상자, 스티로폼상자 그리고 비닐과 종이가 두 겹으로 합쳐진 크라프트용기를 사용해 오미자를 6개월 동안 상온과 저온(5℃)에 저장하면서 부패도, 색도변화, 감모율 등의 변화를 측정한 결과 상온에서 가장 먼저 수분흡수 및 부패가 발생한 용기는 스티로폼상자로 2개월 만에 나타났으며, 플라스틱상자는 3개월이었던 반면, 크라프트용기는 6개월이 지나도 품질변화 및 감모율 변화가 적은 것으로 나타났다. 저온저장에서는 3가지 저장용기 모두 6개월이 지나도 품질변화가 크지 않은 것으로 나타나 상온보다 저온에서 저장하는 것이 효과적이었다.

색도변화는 저장용기 및 저장기간의 영향 보다는 건조 온도에 따라 차이가 크게 나타났다. 자연건조에서 붉은색 오미자 비율이 높으나 건조가 오래 걸리는 단점이 있는 반면, 건조기내 온도를 40℃에서 건조하면 건조시간을 단축하고 오미자 고유의 붉은 색택을 유지 하는데 효과적이었다. 하지만 40℃ 이상의 고온에서는 검은색 종실 비율이 높아져 상품성이 떨어지는 것으로 나타났다.

도 농기원 관계자는 "이처럼 고유 색택을 유지 하도록 품질을 높여 잘 건조한 오미자를 크라프트 용기에 저장하면 상온에서 최대 8개월까지 색상이나 품질 유지가 가능하다"며 "하지만 8개월 이상 장기 저장하면 곰팡이 발생이 시작되어 상품성과 수량이 감소되기 때문에 금후 장기저장에 적합한 지속적인 연구로 오미자 저장과 유통 기간을 늘리겠다"고 말했다.